Сканеры штрихкода и считыватели карт подключаются практически идентично. Для подключения оборудования к 1С:Предприятие при использовании пластиковых карт мы рекомендуем специальный драйвер "АТОЛ: Драйвер устройств ввода".

.
Подробную инструкцию по подключению с разбором самых "тяжелых" случаев можно найти здесь: http://atol.ru/support/encyclopedy/1c/1s81-all/1c81-vvod/

.

Если же разобрать все несколько проще, то инструкции по подключениибудут следующими:

• Установиваем «АТОЛ: Драйвер устройств ввода». Необходимо переписать из папки ...Program FilesATOLDriversBIN все файлы с расширением *.dll в каталог платформы 1C (..Program Files1Сv81bin)
• Зарегистрируем в системном реестре файл Scaner1C.dll командой regsvr32 «[путь к файлу]Scaner1C.dll» (если по каким-то причинам регистрация не произошла автоматически в ходе установки).
• Запускаем 1С:Предприятие. Открываем меню "Сервис", затем "Параметры", после чего переходим на вкладку "Драйвер устройств ввода". Если такой вкладки нет, необходимо повторить процедуру переустановки драйвера. До победного конца. 
• Выбрать параметры связи устройства и поставить галочки "Устройство включено" и "Включать устройство при старте"
• Для проверки настроек нажимаем кнопку "Поиск оборудования" и считываем в зависимости от типа подключенного оборудования со сканера штрихкода - штрихкод c пластиковой карты, с ридера - закодированную пластиковую карту с магнитной полосой

Если мы добились считывания необходимой информации с пластиковых карт, значит наше оборудование работает, и мы можем двигаться дальше.